植物抗病基因的特性分析
在蛋白質(zhì)編碼過程中,某一物種或某一類基因往往傾向于使用某些特定的同義密碼子,這種現(xiàn)象稱為同義密碼子的使用偏性。生物界中廣泛存在著同義密碼子的非均衡實(shí)用現(xiàn)象。分析不同物種的密碼子用法,可為預(yù)測(cè)新基因,判斷基因表達(dá)水平及基因水平轉(zhuǎn)移提供參考。植物病害可給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)造成巨大損失,嚴(yán)重制約了農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。篩選和培育抗病品種是防治植物病害最為經(jīng)濟(jì)、安全和有效的方法。由于人們對(duì)植物 - 病原物相互作用機(jī)制認(rèn)識(shí)的匱乏、植物抗病性的復(fù)雜性及常規(guī)育種本身的局限性,抗病育種一直是農(nóng)業(yè)生產(chǎn)上的重大難題。
可被育種專家選用的抵抗植物病害的基因種類很多,其中最重要的一類是植物抗病基因。近幾年來,植物抗病基因的克隆加深了人們對(duì)植物抗病基因的分子作用機(jī)理的認(rèn)識(shí),對(duì)抗病基因在生產(chǎn)上的應(yīng)用起到了巨大的推動(dòng)作用。利用生物信息學(xué)的方法來研究海島棉抗病基因的抗病機(jī)制及抗病基因進(jìn)化,對(duì)抗病機(jī)制的研究、抗病基因的轉(zhuǎn)育及抗病基因進(jìn)化的研究具有重要的意義。總體來講,前人對(duì) R 基因的生物學(xué)研究主要基于氨基酸水平及同源序列基礎(chǔ)之上,對(duì)于 R 基因的一級(jí)組成的研究還未見報(bào)道,本研究對(duì) R 基因密碼子使用模式進(jìn)行初步分析,從堿基組成水平上探究 R基因特征,為抗病新基因的預(yù)測(cè)和深入研究提供一定的依據(jù)。
密碼子是蛋白質(zhì)的基本單位,基因完整編碼序列中的密碼子用法是分子進(jìn)化中一種重要的進(jìn)化現(xiàn)象,從原核生物到真核生物都廣泛存在。不同物種或同一物種的不同基因?qū)γ艽a子的用法特征可能有所不同,表明這些基因組或基因在進(jìn)化過程中所承受的選擇壓力不同。密碼子不但反映了一些進(jìn)化現(xiàn)象,可以探究許多基本的生物學(xué)問題,研究生物密碼子使用模式,對(duì)于分析物種進(jìn)化壓力以及進(jìn)一步的遺傳研究都有重要的意義。中國(guó)糧油儀器網(wǎng) http://www.yoshikomatsuura.com/